发布时间 : 星期四 文章crystalmaker教程更新完毕开始阅读0d57ec88680203d8ce2f24b4
点击信息框上的按钮；关于选定原子和任何键合原子的信息会显示在Overview Window
上的Log面板(如果Overview window不可见，选择Window > Palettes > Log使其可见)。 三．点击 四．
来放大感兴趣区域：
，并拖动结构，即可移动整个结构。
我们使用屏幕工具
把鼠标指针放在某个原子上并点击。结构会以被点原子为中心放大；可以一直放大到它的键合原子填满屏幕。
选择工具
在Crystalmaker中，可以对选定原子、多面体及原子簇进行隐藏。如果只想对晶体的部分进行操作，用户就需要选择这些原子。选定的原子以黄色或红色的光环标注，可以存储到文件。 选定一个或多个原子，使用的是以下工具： 一．
箭头工具允许选择在一个长方形的结构，点击并拖动整个选择的原子。 1．选定单个原子： (1) 在工具面板中选择
；
(2) 点击想要选择的原子；
(3) 按住shift键，点击选择其他原子。
2．选择矩形范围内的原子： (1) 在想选择区域的一角，点击并按住(2) 拖动鼠标选择一个矩形区域； (3) 释放鼠标，选择的原子就会加亮。
3．选择分子单元内的所有原子： (1) 使用
选定一个原子：
；
(2) 选择Selection > Select Entire Molecule，分子单元内所有键合的原子都被选定。
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4．移动选定的原子： 使用
工具点击并拖动选定原子。按住shift键进行水平或垂直操作。用户也可以使用键
盘上的箭头键移动选定的原子。原子每次移动一个像素的大小，如果按住Option键移动，每次会移动更大的距离。 二．使用
快速隐藏单个原子或多面体：
；
1． 在工具面板中，点击
2． 点击想要隐藏的原子或多面体，当放开鼠标时，原子消失。 三．
多边形工具可定义不规则的选择区域。点击起点完成选择。 选择不规则图形范围内的原子： 1．在工具面板中选择
；
2．点击定义选择区域的第一个点，释放鼠标； 3．继续定义围绕原子的点；
4．最后再次点击开始点，完成区域选择，选择区域内的原子就会加亮。
四．
套索工具定义一个随意的选择区域。有了这个工具，点击并拖动闭环围绕想选择原子 选择圈形区域的原子： 1．在工具面板中选择
；
2．点击并拖动鼠标，定义一个圈形区域； 3．释放鼠标，区域内原子加亮。
测量工具
使用距离和角度工具，可以得到有关结构的定量信息。
一．
化学键距离工具可以测量两个原子中心的三维空间距离。
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1．在工具面板上选择化学键距离工具；
2．选择一个原子，显示为加亮；
3．点击和加亮原子键合的原子，它们之间的实际距离会显示出来；
4．观察Overview window窗口的Log面板。化学键距离会记录在这儿，连同它的矢量；
二．
距离工具可以测量平面内两点的距离。测量平行于屏幕方向的距离。 1．选择距离工具
；
2．鼠标在图片窗口中点击，显示为十字；
3． 移动鼠标，同时保持在图片窗口中。当鼠标移动时，一条线会连在起始点；距离会显示在线的边上；
4． 点击另外一个点，测距完成显示出来。
三．
化学键角度工具可以测量三维空间中三个原子之间的角度。 1．选择化学键角度工具
；
2．点击三个相连的原子；
3．三维方向的角度为在选定的原子边上显示出来，并出现在Log中。 四．
扭转角工具可以测量四个原子之间的扭转角度。 1．选择化学键角度工具
；
2．点击四个相连的原子；
3．扭转角度为在选定的原子边上显示出来，并出现在Log中。 五．
角度工具可以测量平面内三点之间的角度 1．选择化学键角度工具
；
2．任意取三点；
3．三点间角度显示出来，并出现在Log中。
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六．
工具，可以对把晶面沿与其平行的方向进行移动。
Crystalmaker可以显示一个穿过结构的晶面。用户可以定义晶面的位向，对其进行移动，以及以其为界面切除结构。使用1．在结构中移动晶面： (1) 选择晶面工具
；
(2) 在图片窗口中点击并移动鼠标。晶面平行的向前或后移动。
2．旋转晶面： (1) 选择
工具；
(2) 按住option/alt健；
(3) 点击拖动晶面，沿其中心点旋转。
七．
是添加注释工具，同window-palettes-annotation。
八．
用户使用工具，可以创建或删除单个化学键。
如果两个选定原子之间没有化学键，使用这个工具会生成化学键；如果已经存在化学键，使用这个工具会删除化学键。
对于大分子，按住shift健，点击
工具，Crystalmaker主动搜索并生成类似的化学键。
屏幕尺寸工具
一．
点击
，图像为标准屏幕显示。
二．
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