第3章 蛋白质化学答案 联系客服

发布时间 : 星期四 文章第3章 蛋白质化学答案更新完毕开始阅读2c62d66e48d7c1c708a1450b

第三章、蛋白质化学 (一)氨基酸化学部分

1、名称解释

解:必需氨基酸:机体不能自行合成而必须从外界食物摄取的氨基酸。Ile Met Val Leu Trp Phe Thr Lys,对婴儿还有:Arg、His。

非必需氨基酸:能在人体内利用糖代谢中间产物转氨作用合成的氨基酸。

消旋作用:旋光性物质在化学反应中,其不对称原子经过对称状态的中间阶段,失去旋光性的作用。

消旋物:旋光性物质在化学反应中,产生D-型和L-型的等摩尔混合物,失去旋光性的作用。 2、结构式

丙氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、甘氨酸、丝氨酸、谷氨酸、天冬氨酸。

3、为什么组成蛋白质的基本单位是氨基酸。根据氨基酸侧链R基的极性可以分为哪几类?

解:蛋白质水解产物是氨基酸。 分类:

(1)非极性R基氨基酸(8种):脂肪烃侧链的氨基酸(丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸和脯氨酸);芳香族氨基酸:(苯丙氨酸、色氨酸);甲硫氨酸(蛋氨酸)。 (2)、不带电荷的极性R基氨基酸:7种;甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、半胱氨酸 (3)、带正电荷的R基氨基酸:碱性氨基酸,3种;赖氨酸、精氨酸、组氨酸。 (4)、带负电荷的R基氨基酸 :酸性氨基酸,2种;谷氨酸、天冬氨酸。 4、比较几种蛋白质水方法的特点。 解:(1)、酸水解:产物不消旋,为L- 氨基酸;色氨酸被完全破坏;部分分解羟基氨基酸(丝氨酸或苏氨酸)被破坏;Asn、Gln被破坏。

(2)碱解:消旋,产物为D-和L-氨基酸的混合物;多数氨基酸破坏;色氨酸不被破坏

(3)酶解:不消旋,产物为L-氨基酸;不破坏氨基酸;需要几种酶共同作用 5、以芳香族氨基酸为例说明其光吸收特点。

解:在可见光没有光吸收;在紫外部分有特征光吸收,酪氨酸275nm,苯丙氨酸257nm,色氨酸280nm。

6、何为氨基酸等电点?氨基酸在等电点时有什么特性。

解:等电点:氨基酸处于正负电荷数相等即净电荷为零的兼性离子状态时溶液的pH值。

等电点时氨基酸的性质:溶解度最小,可分离不同氨基酸。pH=pI,氨基酸在电场中既不向正极也不向负极移动。pH>pI,氨基酸带净负电荷;pH < pI ,氨基酸带净正电荷。

7、叙述氨基酸和下列物质反应的化学本质,说明反应在生物化学领域的应用。 解:亚硝酸:室温下,氨基酸与亚硝酸作用,很快生成氮气。可用于测游离AA含氮量和蛋白质的水解程度。

甲醛:氨基酸的氨基与甲醛反应生成羟甲基氨基酸和二羟甲基氨基酸,使反应向放出质子的方向移动,酸性增加,PH降低,可用氢氧化钠滴定测游离AA含氮量

和蛋白质的水解程度。

茚三酮:在弱酸溶液中与a-氨基酸共热,氨基酸即被氧化脱氨产生酮酸,酮酸脱羧成醛;茚三酮则被还原为还原茚三酮,再与茚三酮、氨作用产生蓝紫色物质。常用于氨基酸和蛋白质的定性或定量分析。 8、计算甘氨酸、赖氨酸和谷氨酸的等电点。 解:甘氨酸:PI=(2.34+9.60)/2=5.97 赖氨酸:PI=(8.95+10.53)/2=9.74。 谷氨酸:PI=(2.19+4.25)/2=3.22。 9、、欲在PH6.0的正丁醇体系中,利用纸层析分离氨基酸,请判断下列氨基酸的Rf的顺序并说明原因,Val、Leu、Asp、Ser。

解:滤纸纤维上的羟基具有亲水性,因此吸附一层水作固定相,有机溶剂作流动相。Rf 和氨基酸的极性有关,极性越小Rf越大。氨基酸的极性和侧链R的电荷、清水基团、大小有关。在PH6.0时,Asp侧链带电荷,Ser侧链有羟基,Val的侧链比Leu小。所以Rf从大到小的顺序为: Leu、Val、Ser、Asp。

10、欲在PH6.0的缓冲液中,利用离子交换层析分离氨基酸,请判断下列氨基酸的洗脱顺序并说明原因,Leu、Asp、Ser,Lys。

解:氨基酸的阳离子和阴离子在一定PH溶液中能同离子交换剂进行离子交换。在酸性溶液中(对氨基酸的等电点而言)氨基酸本身为阳离子,能同阳离子交换剂(以MA代表)交换阳离子;在碱性溶液中其本身为阴离子,能同阴离子交换剂 (以MB代表)交换明离子。与离子交换剂结合的氨基酸经适当电解质溶液洗脱,氨基酸离子又会重新交换出来,亲和力小的氨基酸(和电荷、极性有关)先被洗脱下来.这样.就可使溶液中的各种氨基酸彼此分开。

在PH6.0时,氨基酸带正电荷从少到大的顺序为:Asp、Leu-Ser、Lys。

而Ser侧链有亲水基团,极性比Leu大。所以,洗脱顺序为:Asp、Ser、Leu、Lys。

(二)蛋白质部分

1、解释下列名词

解:蛋白质一级结构:蛋白质的一级结构指蛋白质多肽连中AA的排列顺序和二硫键的位置。

肽平面 :-CO-NH-中的四个原子和与它相邻的两个Ca组成的平面。 蛋白质二级结构:多肽链的主链在一级结构的基础上,以肽键平面为基本单位的肽链通过氢键形成而折叠、盘曲 形成的主链构象。有α-螺旋,β-折叠,β-转角结构和无规则卷曲等 。

β-转角:蛋白质分子多肽链上出现180°的回折叫β-转角结构,

蛋白质三级结构:多肽链在二级结构、超二级结构、结构域的基础上,进一步盘绕、折叠形成的包括主链和侧链构象在内的特征三维结构。是多肽链上的所有原子(包括主链和侧链)在三维空间的分布。 蛋白质四级结构 :蛋白质的四级结构:是指蛋白质亚基的相互关系,空间的排列,亚基间通过非共价键聚合而成的具有完整地生物学活性的特定构象。

超二级结构:指若干相邻的二级结构中的构象单元彼此相互作用,形成规则的,在空间上能够辨认的二级结构组合体。

双缩脲反应:2分子双缩脲与碱性硫酸铜作用,生成粉红色复合物。蛋白质的肽链有此反应盐析:向蛋白质溶液中加入大量的中性盐(硫酸铵、硫酸钠或氯化钠等)后可以吸去乳胶外层的水、减低蛋白质与水的亲和力而使蛋白质沉淀,此作

用称盐析。,

结构域:指多肽链在二级结构或超二级结构的基础上,进一步卷曲、折叠形成几个相对独立、紧密球状实体。在空间上彼此分隔,各自具有部分生物功能的结构。

寡聚蛋白:由两个或多个亚基组成的蛋白质。具有四级结构的蛋白属于寡聚蛋白或多体蛋白。

盐溶:溶液中低浓度的中性盐能增加蛋白质溶解度的现象 透析:根据蛋白质不能通过半透膜的性质,将待提纯的蛋白质溶液装在半透膜的透袋里放在蒸馏水中,外液不断更换,直至透析袋内无机盐等小分子物质降低到最小为止。

超过滤:根据蛋白质不能通过半透膜的性质,利用压力或离心力,强行使水和其它小分子物质通过半透膜,而蛋白质被保留。

亚基:四级结构中,每个球状蛋白质为亚基(亚单位、单体),亚基可以是一条或多条肽链。

2、说明蛋白质的元素组成、分类和生物学功能

解:组成:蛋白质由C、H、O、N四种元素组成,多数含有S,有的含有微量铁、铜、锌、碘和磷等元素。 分类:

(1)蛋白质分子形状:球状蛋白质、纤维状蛋白质。 (2)蛋白质分子组成:简单蛋白质、结合蛋白质。 (3)生物功能:酶、结构蛋白、防御蛋白等。 生物学功能:作为有机体新陈代谢的催化剂(酶);生物体的结构成分(胶元蛋白);贮藏功能(作为生物体养料和胚胎或幼儿生长发育的原料。);运输功能(血红蛋白);运动功能(肌动蛋白和肌球蛋白);调节功能(激素);参与高等动物的免疫反应(抗体和免疫蛋白);控制或调节遗传物质核酸的作用(组蛋白);提供能量等。

3、叙述分析蛋白质一级结构的基本流程

解:测定蛋白质中多肽链的数目;拆分蛋白质分子的多肽链,分离纯化各肽链;拆开多肽链内的二硫键;分析各肽链的氨基酸组成;鉴定多肽链的氨基末端残基和羧基末端残基;用两种不同的裂解方式裂解多肽链成较小的片段;测定各片段的氨基酸顺序;用片段重叠法重建完整多肽链的一级结构;确定二硫键的形成方式。

4、说明蛋白质一级结构测定时多肽链的拆分、二硫键的断裂、N-末端分析、C-末端测分析、二硫键位置确定的原理。

解:多条多肽链组成进行拆分:可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍处理,即可分开。

二硫键的断裂:几条多肽链通过二硫键交联在一起。可在可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍存在下,用过量的?-巯基乙醇处理,使二硫键还原为巯基,然后用烷基化试剂(ICH2COOH)保护生成的巯基,以防止它重新被氧化。可以通过加入盐酸胍方法解离多肽链之间的非共价力;应用过甲酸氧化法拆分多肽链间的二硫键。 N-端氨基酸分析法:(1)二硝基氟苯(DNFB)法;(2)丹磺酰氯(DNS)法;(3)苯异硫氰酸酯(PTC)法;(4)氨肽酶法。 C-末端测分析:肼解法、还原法、羧肽酶法。

二硫键位置确定:一般采用胃蛋白酶水解含二硫键的蛋白质,水解得到的肽段混合物可用Brown及Hartlny对角线电泳技术分离。

5、叙述Sanger法和Edman法进行N-端氨基酸分析的原理

解:Sanger法:2,4-二硝基氟苯在碱性条件下,能够与肽链N-端的游离氨基作用,生成二硝基苯衍生物(DNP)。在酸性条件下水解,得到黄色DNP-氨基酸。该产物能够用乙醚抽提分离。不同的DNP-氨基酸可以用色谱法进行鉴定。 Edman法:多肽或蛋白质的末端氨基能与PITC作用,生成苯氨基硫甲酰多肽或蛋白质( PTC-多肽或蛋白质),它们在酸性有机溶剂中加热时,N末端的PTC-氨基酸发生环化,生成苯乙内酰硫脲的衍生物并从肽链上脱离。脱去N末端氨基酸后剩下的肽链仍然是完整的。重复反应可以用来测定氨基酸顺序。

6、叙述蛋白质在胰蛋白酶、糜蛋白酶、胃蛋白酶、溴化氰作用下的裂解特点。 解:胰蛋白酶:水解Arg、Lys的羧基和其他氨基酸(Pro除外)氨基形成的肽键。

糜蛋白酶:水解Phe, Trp,Tyr(芳香族氨基酸)的羧基和其他氨基酸(Pro除外)氨基形成的肽键。

胃蛋白酶:水解Phe, Trp,Tyr(芳香族氨基酸)的羧基和其他氨基酸(Pro除外)氨基形成的肽键。

溴化氰:水解甲硫氨酸的羧基和其他氨基酸(Pro除外)氨基形成的肽键。 7、叙述维系蛋白各级结构的键。 解:一级结构:肽键、二硫键。

二级结构:链内或链间形成的氢键。

三级结构:氢键、范德华力、疏水键、离子键(盐键)、二硫键 ,疏水键是使蛋白质多肽链进行折叠的主要驱动力。 四级结构:非共价键(次级键):氢键、范德华力、疏水作用和盐键(离子键) 8、叙述α-螺旋的特点和影响α-螺旋形成的因素

解:α-螺旋:多肽链的主链原子沿一中心轴盘绕所形成的右手螺旋结构。 α-螺旋的特点:

以肽键平面为基本单位,Cα为转折,绕中心轴形成右手螺旋。

a-螺旋是一个棒状结构,紧密卷曲的多肽主链形成棒的内部,侧链向外伸展。 每圈螺旋占3.6个氨基酸残基,沿螺旋轴方向上升0.54nm(螺距)。每个残基绕轴旋转100°,沿轴上升0.15nm。

氨基酸残基侧链‘R’伸向外侧。不计侧链,螺旋直径0.5nm。 相邻的螺圈之间形成链内氢键,氢键的去向几乎与中心轴平行。 从N-末端出发,氢键是由每个肽基的C=O与其前面第3个肽基的N-H 之间形成的。 由氢键封闭的环是13元环,因此α-螺旋也称3.613-螺旋。

影响因素:是由相邻的氨基酸残基的侧链基团决定的,要求相邻的氨基酸残基不产生太大的排斥力,和氨基酸侧链的大小、电荷有关。在肽链上连续排列酸性或碱性氨基酸残基,由于所带电荷同性相斥,不利于α—螺旋的形成。较大的R侧链基团,如I1e、Phe、等集中的区段,因空间位阻的影响,不利于α—螺旋的形成;甘氨酸残基,由于没有侧链的约束。其中Φ与Ψ角可以任意取值,从而使形成α—螺旋所需要的二面角的几率很小。如果在肽链上连续排列,则α—螺旋不能形成;脯氨酸残基,由于其N原子位于刚件的吡咯环上,其Cα—N键不能旋转,因而不可能形成α—螺旋所需的Φ角。加上不可能形成链内氢键。脯氨酸残基是影响α—螺旋形成的最大障碍。