体外诊断试剂 - 相关指导原则的统计学 联系客服

发布时间 : 星期三 文章体外诊断试剂 - 相关指导原则的统计学更新完毕开始阅读6c1f397569dc5022abea00af

5、定量试剂的定性计算:这个在不少的指导原则中都提出来了,个人觉得应该对于有参考值的试剂应同时进行定性的统计。

我想进行完以上的统计后,可以形成一个完整的报告了。

半定量试验(有序变量)

半定量检验试剂种类相对应该少一些。在临床统计上,个人觉得和定性试剂有些接近,或定性试剂是半定量试剂的一个特例。在相关指导原则上,明确指出统计方法的比较少。类比于比定性试剂,我想同样是在3个方面进行分析:

1)基础的计算,也就是区间的符合率,这相当于定性的阳性或阴性符合率;

2)差异性检验,在统计上对有序的变量一般采用秩和检验方法,而不是卡方检验。这里需要提出的是,理论上用配对的秩和检验是最合适的,然而配对的秩和检验将相同的结果不列入统计,只比较有差异的结果。由于半定量的试剂相同的结果数据很多,显然这种结果一些情况下能反映试剂的真实性能,这一点在很多文献中都指出来了。个人认为采用单向有序的秩和检验更能反映试剂的实际性能。在IVDstatistics中,可以计算这两种统计结果,供研究都选择。

3)Kappa一致性检验,其意义和定性相同,但对于有序的半定量试剂,理论上应采用(线性)加权的一致性的Kappa一致性检验。简单的一致性忽略了数据间的联系,不如加权的一致性结果准确。

通过以上3个方面的分析,足以判定出临床试验试剂的性能。

鉴于快节奏的工作环境。IVDstatistics提供的亦是方便、快捷或傻瓜化统计。提供了完全的WORD生成模板,例如下(自动生成):

芸豆荚IVD统计程序定性统计方法和结果

1、 检测数据

对照试剂和临床考核试剂对样本进行配对检测后,将配对检测结果输入表1: 表1:对照试剂和临床考核试剂配对检测结果

考核试剂

对照试剂

+

+ - 合 计

A C A+C

180 8 188

B D B+D

- 5 200 205

A+B C+D ABCD

合计

注:A、B、C、D分别表示配对检测的四种结果

参照体外诊断试剂临床研究技术指导原则(国食药监械[2007]240号),人类免疫缺陷病毒检测试剂临床研究注册技术审查指导原则,病原体特异性M型免疫球蛋白定性检测试剂注册技术审查指导原则,流行性感冒病毒检测试剂注册申报资料指导原则等法规性文件,根据

表1的数据,采用芸豆荚IVD统计程序对数据进行以下统计分析。

2、 基础计算

根据文献[1],基础计算结果如下: 表2:检测数据基础统计结果 编号 阳性符合率 阴性符合率 阳性预期值 阴性预期值 总符合率 数值比 180/188 200/205 180/185 200/208 380/393 百分率(95%可信区间) 95.74% (91.79%~98.15%) 97.56% (94.40%~99.20%) 97.30% (93.81%~99.12%) 96.15% (92.56%~98.33%) 96.69% (94.41%~98.23%) 注:结果和MedCalc相同,95%可信限计算方法:二项分布法(推荐)

3、 卡方检验(McNemar检验)

根据文献[1,2]采用配对卡方检验,建立检验假设: H0:两种试剂总体检验符合率相同,H1:两种试剂总体检验符合率不同,α=0.05 计算结果如下: 表3 卡方检验(McNemar检验)统计结果 编号 检验方法 卡方值 概率值P 检验结果 统计值 精确概率法 无 0.5811 P>=0.05,接受H0,两种试剂总体检验符合率相同 注:依据不同的检验方法,结果和SPSS、SAS等相同

4、 Kappa一致性检验

根据文献[1,3],计算Kappa值及标准误;对Kappa建立检验检验假设: H0:K=0,Kappa值来自0的总体,H1:K>0,Kappa值来自非0的总体,α=0.05 计算结果如下: 表4 Kappa一致性检验统计结果 编号 Kappa值 标准误Se(K) 95%可信区间 标准误Se0(K) 检验值Z 统计值 0.9337 , 一致性较好 0.0181 0.8982~0.9691 0.050 Z=18.5115,概率值P=0.0000 检验结果 注:结果和SAS,MedCalc相同 P<0.05,拒绝H0,Kappa值来自非0的总体

附:芸豆荚IVD统计程序统计学方法说明

计算方法均来源于经典的文献或统计学软件,结果和SPSS,SAS、MedCalc等软件相同,主要计算方法如下: a) 基础计算: 按表1的代号:

阳性符合率=A/(A+C)×100% 阴性符合率=D/(A+B) ×100% 阳性预期值=D/(B+D) ×100% 阴性预期值=D/(C+D) ×100%

总符合率=A+D/(A+B+C+D) ×100%

率的95%可信区间采用二项分布法计算(同MedCalc程序),公式如下: , ,式中a为数值比分子,n为数值比分母。 b) 卡方检验

依据参考文献[1,2],精确概率法检验(同SPSS程序)计算方法:X2= ×2,自由度v=1。 ,再根据卡方X2值和卡方分布函数计算出概率值P。

c) Kappa一致性检验(结果同SAS,MedCalc等程序)

依据参考文献3,对于行为i=2,列为j=2排列的数据:计算公式如下: 一致性系数Kappa= 式中 ;

用于估计95%可信限的标准误计算公式如下:Se(k)= ,式中:

Kappa值的95%可信区间=Kappa+/-1.96Se(k)。

Kappa值非0检验,即检验Kappa值是否来自为0的总体,即Kappa值的差异是否由抽样误差造成的,计算公式如下:Z=Kappa/Se0 (k),式中

Se0(k)= ,再根据Z值和标准正态分布函数,计算出概率值P。

参考文献

1、 颜红主编. 医学统计学(第2版),人民卫生出版社. 2010

2、 刘一斑秀,刘钧. 配对四格表资料差别检验的精确概率方法,南京大学学报. 1998, 34(5):627-631

3、 Joseph L. Fleiss. Statistical Methods For Rates And Proportions - 3Ed, 2003,598-607 4、 体外诊断试剂临床研究技术指导原则(国食药监械[2007]240号),国家仪器药品监督管理局发布

5、 人类免疫缺陷病毒检测试剂临床研究注册技术审查指导原则,国家仪器药品监督管理局发布

6、 病原体特异性M型免疫球蛋白定性检测试剂注册技术审查指导原则,国家仪器药品监督管理局发布

7、 流行性感冒病毒检测试剂注册申报资料指导原则,国家仪器药品监督管理局发布

芸豆荚IVD统计程序定量统计方法和结果

(发现图片无法贴上来) 1、检测数据

对照试剂和考核试剂对样本进行配对检测后,将配对检测结果输入附表1,参照体外诊断试剂临床研究技术指导原则(国食药监械[2007]240号),肿瘤标志物类定量检测试剂注册申报资料指导原则,人类免疫缺陷病毒检测试剂临床研究注册技术审查指导原则,病原体特异性M型免疫球蛋白定性检测试剂注册技术审查指导原则等法规性文件,根据附表1的数据,采用芸豆荚IVD统计程序对数据进行以下统计分析。

2、基础计算

计算试剂及差值的均值、标准差、最大值、最小值、偏度和峰度,对样本的基本情况进行分析,依据文献[1],计算结果如下: 表1:基础计算结果 编号 均值 标准差 最大值 最小值 偏度 峰度

配对差值组 -8.650 56.641 79.000 -96.000 0.0342 -1.4534

对照组 489.000 175.150 778.000 149.000 -0.1882 -0.5856

考核组 497.650 184.888 874.000 141.000 0.0320 -0.4512

注:结果和SPSS,MedCalc相同

3、数据分布直方图

将检测数据及差值按十等份划分,作直方图,直观显示样本及差值的分布情况:

图1: 对照试剂值分布直方图 图2: 考核试剂值分布直方图 图3: 检测差值分布直方图

4、正态性检验

依据文献[2,3]采用D(D'Agostino)检验进行正态性检验,以进一步选择合适的统计方法,建立假设: H0:数据总体服从正态分布,H1:数据总体服不从正态分布,α=0.05 计算结果如下: 表2:数据差值正态性检验结果: 编号 偏度G1 峰度G2 差 值 Z=0.0710, P=0.9434 Z=1.4162, P=0.1567 对照试剂 Z=-0.3894, P=0.6970 Z=0.7946, P=0.4268 考核试剂 Z=0.0664, P=0.9471 Z=0.6783, P=0.4976