发布时间 : 星期四 文章MS常见问题及解答( Materials Studio)更新完毕开始阅读f38dec14cc7931b765ce15ff
msilicense.dat。
5)、把/home/firefox/MaterialsStudio/License_Pack/licenses/msilicense.dat完整的文件名按提示输入。这些完成后。就基本 安装好了。下面就是把gateway运行起来。
4、到/home/firefox/MaterialsStudio/Gateway目录，运行下面的命令： ./msgateway_control_18888 start
提示说Gateway start succeeded - running as process xxxx。后，就启动成功了。 5、在ie的地址栏输入，http://127.0.0.1:18888/ ; 则页面会显示该机器上已经安装好的计算模块
基本就安装成功了。(注意之处：不要用root安装它)。
7、问：我想对NaYF4的电子云分布进行模拟计算,请各位高手指点怎么计算?如果有NaYF4的结构的话,请分享一下.
答：如果是晶体的话，可以找相关的文献看晶格常数和原子坐标，自己构建模型后计算
如果没有文献，可以上无机晶体结构数据库ICSD查询，如果查到，直接导出来
就可以用ms算了
电子云分布算一下电子密度就可以了 可以用dmol和castep
如果要某个轨道的电子云，dmol算homo－lumo上下若干个轨道 castep算能带
最后那visulizer看电子云密度图就ok了
8、问：各位高手请教一下用demolJ计算分子轨道怎么看HUMO,LUMO图，其中的黄色蓝色代表什么啊，谢谢了
答：dmol计算的时候选择properties里面的orbitals 把homo和lumo选上
然后计算，算完以后打开analysis对话框
选择orbitals，就看到你算的homo和lumo了，然后import就在模型中可以看见homo和lumo了
9、求助有MS并行计算经验的朋友解答一下
我虽然在LINUX CLUSTER并行成功了，但是并行的时候CPU计算利用率很不均衡也不稳定
有时候100%有时候0%
而且计算到一定程度的时候会变换运行程序在LINUX中的进程名
换了一次之后CPU使用就开始出现不均衡的情况，有一个CPU 90%+，别的都是2-5%的样子进程处与sleeping状态只有那一个CPU在RUN
另外说一下我每个节点的硬件配置相同，用的是CASTEP模块，K点数是CPU数的整数倍，但是算能带的时候不知道如何调节K点数目，
不均衡不知道是不是算能带的时候导致K点在每个CPU上分布不均造成的 还想问一下 我各个节点都是同一个交换机下的机器，NFS的效率如何评估 答：A、你应该看看内存的使用率,一般如果内存不足,会造成你说的现象 B、所有节点空闲内存都在50%以上啊，发现只有一个节点的CPU占用的厉害 别的不超过10%
C、你选用的几个cpu进行计算,如果是一个,那就是你发生的问题原因,如果不是一个,而是选择几个cpu进行计算,那么应该是节点之间 的通讯问题了,这需要进行机群的的调节了
10、问：CASTEP能算pdos的自旋情况吗 答：可以计算体系的自旋态密度 alpha和beta分别为自旋向上和自旋向下 total spin是总自旋
计算的时候必须把自旋极化－spin polarized 选上才能画自旋态密度
11、问：大家帮忙看看这是什么问题
我再用demol计算动力学的时候,不管怎么设置参数它老出现这个提示 Error: SCF iterati***** not converged in 50 iterati*****
Message: SCF not converging. Choose \
or set \ Thermal\You may also need to change spin or use symmetry Resubmit DMol3 Message: DMol3 job failed Error: DMol3 exiting 请教高手这是什么原因啊?
答：SCF not converging. Choose \or set \ Thermal\无法收敛，加大计算步数。
你错误的原因是体系在50步内不能收敛,你可以增加收敛计算步数,比如增加到100
系统提示你改变\和\ Thermal\的设置参数(这两个参数在设置对话框中),还提出建议让你改变自旋和对 称设置来试一试。
不收敛，解决方法一加大圈数，DMol3 calculati*****－》electronic标签下More选项－》SCF选项，中Max. SCF Cycles加大，最多 1000圈，如果1000圈收敛不了 就用方法二，加大smearing
在SCF标签下把orbital occypancy下面的勾打上，然后设置smearing 设置重小到大逐渐增大，smearing如果很大，虽然能收敛但是最后的构型有问题。
做MS计算，我的感觉是没有必要一步算到位，就是说你的计算精度（能量，力等等）可以一步一步来，或者是smearing慢慢变小，这 样容易收敛些。
12、新手请教几个不专业的问题 1.(1x1)CO中(1x1)是什么意思？
2.态密度、能态密度和电子态密度的区别？ 3. K││-resolved是什么意思？
4.如何在半导体上建金属表面？ 5.如何翻译？
supercell geometry
the Vienna ab-initio simulation package (VASP) the generalized gradient approximation the plane wave expansion structural relaxati*****
a tight-binding linear muffintin orbital (TB-LMTO) method the TB-LMTO method
the principal-layer Green’s function technique the K││-resolved transmission
6．K││-resolved DOS at the Fermi energy这句话怎么理解啊？ 7．用MS能不能计算一个体系的电导？如何去算？
答：1. (1×1)表示的是表面的构型，2×2是(1×1)的四倍，也就是x和y上分别用两倍单位平移定义表面的晶格常数a和b，c轴与表面 方向平行，c的大小取决于原子层和真空层厚度 2.应该是没有区别，可能是称呼不同而已。 3.不清楚什么意思
4. 用ms里面的layer builder构建界面，基底为半导体，半导体上长金属层是通过layer builder构建的
5. supercell geometry——超胞结构
the Vienna ab-initio simulation package (VASP) ——维也纳从头算模拟软件包
the generalized gradient approximation——广义梯度近似 the plane wave expansion——平面波展开 structural relaxati*****——结构弛豫
a tight-binding linear muffintin orbital (TB-LMTO) method——紧束缚线性丸盒轨道
the TB-LMTO method——紧束缚线性丸盒轨道方法